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整理番号 6947   (公開日 2015年05月28日) (カテゴリ バイオテクノロジー医学・薬学情報・通信
バイオビッグデータ検索・解析アルゴリズムの研究
●内容  計算生物学(バイオインフォマティクス)におけるアルゴリズムを生物医学分野における大規模データ(ビッグデータ)に対するアルゴリズム研究を中心に行っている。大規模データからの高速検索アルゴリズムや、それを活用したタンパク質等の機能解析アルゴリズムなど、ビッグデータを利用するためのアルゴリズム基盤の構築を行っている。
 特にこの研究室で実現したタンパク質立体構造検索アルゴリズムは、従来手法と比較し理論的にも実用的にも、精度を全く落とさず数十倍〜数百倍の高速化を実現し、世界的にも、当該分野の最高峰国際会議で最優秀賞を得るなど注目されている。また、このアルゴリズムは単にタンパク質立体構造のみならず、一般的な高次元座標列の類似検索に応用可能なものである。その他、データを圧縮したままの検索、秘匿したままの検索などより高度な検索アルゴリズムに関する研究も行っている。この研究に興味のある企業との共同研究を希望する。
●研究者
准教授 渋谷 哲朗
医科学研究所 附属ヒトゲノム解析センター
●画像


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精度を落とさずにタンパク質立体構造データベースに対する超高速検索を実現した。
(C) 渋谷 哲朗
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上記内容は、各研究者へのインタビューをもとに東京大学 産学協創推進本部で骨子をまとめたものです。
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